El Colegio Santo Tomás fue fundado en 1992 por la Corporación Educacional del Arzobispado de Santiago y construido en los terrenos donados por el empresario Jorge Cisternas. Como una respuesta al llamado del rol misionero de la Iglesia, CEAS acogió la necesidad de las mujeres trabajadoras y jefas de hogar que buscaban una educación y formación católica para sus hijos e hijas. Inserto en la comuna de La Pintana, sector de alta vulnerabilidad, en sus inicios ofreció 2 cursos por nivel de enseñanza básica con financiamiento compartido. Luego en el 2000, el colegio comenzó un proyecto de ampliación para acoger a los mismos estudiantes que egresaban de 8°básico y así dar continuidad a sus estudios.
Con 25 años de historia el colegio acoge a niños, niñas y jóvenes vulnerables, entregando herramientas pedagógicas y preparándolos para un mejor futuro. El colegio cuenta con una fuerte participación y compromiso de las familias. Se preocupa de promover valores y formación en la fe, sin importar las creencias, donde la solidaridad y la formación de la persona han sido pilares del colegio.